Kedatangan Venom dan Ancaman Xenophage
Setelah mantra Doctor Strange memindahkan Eddie Brock dan simbiote Venom ke Bumi-616, mereka mabuk di sebuah bar di Meksiko. Bartender memberi tahu mereka tentang Thanos dan Batu Infinity, kemudian mereka kembali ke alam semesta mereka di Bumi-688, ke bar yang sama. Pembunuhan Patrick Mulligan yang tampak jelas menjadi masalah besar, dan Eddie menjadi tersangka utama, memaksanya pergi ke N.
Xenophage, makhluk tak dikenal, mulai mengikuti Eddie dan Venom. Seorang prajurit bernama Rex Strickland mengelola Imperium, operasi pemerintah di Area 51 yang akan segera dinonaktifkan untuk menangkap dan menyelidiki simbiote lain yang jatuh ke Bumi. Mulligan, yang selamat dari pertarungannya dengan Carnage, tertangkap setelah simbiote lain meninggalkannya. Strickland, yang terhubung dengan salah satu simbiote yang ditahan, diminta oleh peneliti Imperium Dr. Teddy Paine dan Sadie “Christmas” untuk mencari tahu tujuan mereka di Bumi sebelum diperintahkan untuk menjatuhkan Venom.
Perburuan Codex dan Pertarungan di Area 51
Xenophage menyerang Eddie dan Venom saat mereka menempel di sisi pesawat menuju New York City, menyebabkan mereka jatuh ke gurun Nevada. Venom menjelaskan kepada Eddie bahwa Knull, pencipta simbiote, melepaskan Xenophage untuk mengambil Codex. Codex terbentuk ketika simbiote menghidupkan kembali inangnya, dan ini dapat membebaskan Knull dari penjara. Karena Venom pernah menghidupkan kembali Eddie, mereka membawa Codex. Setelah Strickland dan timnya menyerang mereka, Eddie bertemu Martin Moon dan keluarga hippies-nya. Sementara itu, simbiote Mulligan yang baru memberi tahu Strickland tentang niat Knull atas Codex, yang hanya dapat hancur jika Eddie atau Venom mati.
Eddie dan Venom tiba di Las Vegas, bertemu Mrs. Chen, lalu Xenophage merampok mereka lagi. Strickland dan pasukannya tiba, memisahkan Venom dari Eddie, dan membawa mereka ke Area 51. Di sana, Eddie bertemu Mulligan. Sadie membebaskan Venom, dan mereka kembali bergabung dengan Eddie setelah Strickland membunuhnya. Ini menarik Xenophage ke pangkalan, dan Mulligan terbunuh dalam pertempuran. Venom melepaskan simbiote lain yang bergabung dengan Sadie dan inang lainnya untuk melawan Xenophage, yang telah memberi tahu Knull tentang Codex. Knull mengirim lebih banyak Xenophage, menghancurkan simbiote. Venom mengorbankan diri untuk menghancurkan Codex dan menyelamatkan alam semesta, membawa Xenophage ke dalam tangki asam, dan mengucapkan selamat tinggal kepada Eddie sebelum mengusirnya. Strickland yang terluka parah mengeluarkan granat untuk menghancurkan mereka. Teddy terhubung dengan simbiote untuk menyelamatkan Sadie dari ledakan, sementara Eddie pingsan saat pangkalan terbakar.
Konsekuensi dan Akhir
Seorang pejabat militer memberitahu Eddie di rumah sakit bahwa tindakannya dengan Venom di Area 51 mengakibatkan pemecatannya, tetapi dia harus merahasiakan peristiwa yang terjadi. Setibanya di New York City, Eddie merenungkan Venom saat melihat Patung Kemerdekaan. Dalam adegan pasca-kredit, Knull menyatakan bahwa alam semesta tidak lagi aman darinya karena Venom telah jatuh. Setelah kredit berakhir, bartender yang ditahan Strickland melarikan diri dari sisa-sisa Area 51 yang terbakar. Seekor kecoa hitam merangkak keluar dari puing-puing di samping botol pecah yang berisi sampel simbiote Venom.